一、深化公共卫生体制改革，加快突发公共卫生事件应急体系建设。利用国债建设项目和市政府为民办实事的有利条件，加快昆明市疾病预防控制中心和十四县（市）区疾病预防控制中心建设，使其设施设备进一步完善，建立功能完善、反应迅速、运转协调的突发公共卫生事件应急机制，提高预警和应急反应能力。
二、推进依法行政，加强卫生执法监督工作。进一步改善卫生监督机构建设和加强执法队伍建设，明确以食品安全和传染病防治为监督重点，创新监管机制，开展食品生产经营企业量化分级管理，推进学校食堂分级管理机制，积极实施“食品放心工程”，使全市食品卫生安全得到明显改善。根据《关于进一步加强农村卫生工作的决定》，要把监督重心下移，强化对农村的卫生监督检查，授权乡镇卫生院负责辖区的卫生执法监督工作。
三、进一步深化城市医疗卫生体制改革。优化城市医疗资源配置，建立新型医疗服务体系。推动医疗机构关、停、并、转，合理调整医疗机构的规模和布局，逐步建立起多种层次、多种形式的医疗卫生服务体系，重点探索卫生投融资改革，吸纳社会资本参与国有医疗机构的改革，逐步建立“股份多元化”的医疗机构，加强医疗机构的合理竞争，提高医疗服务水平。